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親子鑒定原理依據的是孟德爾遺傳學。子女的基因型一半來自母親，另一半來自父親。標準的的三聯體親子鑒定就是父母雙方都參與，做父母子三人的親子鑒定，通常這里的母親是孩子的生物學母親，父親為可疑父。如果母親也是不確定的，就是雙親皆疑三聯體，母親不參與鑒定二聯體親子親子鑒定。那么親子鑒定是否需要父母雙方都參與呢？

      司法親子鑒定一般都是建議父母雙方都參與。   

      司法親子鑒定是具有司法效力的，涉及到父親的權利和母親的權利，一般建議雙方都參與的。有人疑問，母親本身就是可以確認孩子是她生的，應該是沒有必要參與的，特別是一些司法親子鑒定僅用于孩子繼承父親這邊權益的時候。如有些孩子隨父落戶要求的親子鑒定，為何也需要另外一方參與呢？父母同時參與做司法親子鑒定是一般雙方同時作為委托人委托辦理的。相當于是兩者都同意做親子鑒定確認親子關系。這樣就避免了一方未參與而不認可參與方的單親親子鑒定。

     個人親子鑒定大部分是父母一方參與。

     個人親子鑒定大部分是做父母一方參與的父子倆的親子關系鑒定。涉及到個人家庭的隱私，有可能是男方帶孩子，或采集孩子的樣本做親子鑒定的事情是隱瞞著女方的。這個時候完全可以父母一方參與就可以的。再者，個人親子本身就是一項DNA檢測技術服務，不要求當事人到場，未參與方是否愿意進行DNA鑒定也是不而知，可以很多的避免因一方拒絕導致不能自行確認親子關系。

     親子鑒定在判定親子關系的標準上要求父母雙方參與。

      做單親親子鑒定的時候，在單親風險提示單有提示：檢測過程中如若父權概率達不到規定出報告的數值時，需加做檢測系統或提供母親樣本。也是親子鑒定技術在達到累積親權指數大于10000才給出肯定的鑒定意見的，若基因突變導致親權指數不達標，則需要父母一方參與的鑒定增加檢測為父母雙方都參與的鑒定。當然若是未參與方確實不能參與，增加已經檢測的單親親子鑒定的父子倆的基因座位點到40個位點就可以。